Tout comme pour les autres grands instituts culturels de la ville de Berne, un contrat de prestations courant sur plusieurs années a été conclu avec le Zentrum Paul Klee. Celui-ci inclut la participation financière des communes de la région aux frais d’exploitation en vertu de la loi cantonale de promotion de la culture.

Les recettes d’exploitation du Zentrum Paul Klee et des moyens privés (sponsoring) fournissent au centre les fonds manquants.

Les subventions des instituts culturels bernois
Aucun autre institut culturel de Berne n’est aussi peu subventionné que le Zentrum Paul Klee. C’est ce qu’a montré le débat de la session de novembre 2004 au cours duquel Peter Eberhart, député, Erlenbach (UDC) avait posé la question suivante: quelle est la part subventionnée d’un billet dans les divers instituts culturels. Le calcul est le suivant: additionner toutes les contributions financières de sponsors, associations, subventions de la ville et du canton, moins les recettes d’entrée, divisé par le nombre d’entrées payées. Le calcul fait selon la proposition du requérant donne le résultat suivant (base: comptes 2003).

Subvention par entrée

Musée des Beaux-Arts Berne: (57 000 visiteurs):	CHF 90.00
Kunsthalle Berne: (10 700 visiteurs)	CHF 112.50
Musée alpin suisse: (25 000 visiteurs)	CHF 33.50
Théâtre municipal Berne: (240 000 visiteurs)	CHF 174.00
Zentrum Paul Klee: (estimé à 150 000 visiteurs)	CHF 14.60